Adobe Creative Suite 3の時はFileVaultがonになっているとインストールに失敗するので、インストールの時はFileVaultを一時的にoffにしないとなりませんでしたが、Adobe Creative Suite 4ではFileVaultがonでもインストールできるようになってますね。
今時のMac OS Xにはホームフォルダの内容を暗号化するFileVault機能があります。この機能を使うとログインパスワードでログインしない限り暗号は解除されません。
さすがに、デスクトップには使っていませんが、Macbook AirではFileVault機能をonにしています。